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GIGABYTE Server W291-Z00工作站實測開箱,史上最強AMD EPYC 7001系列處理器運算神器!
文.圖/ITMan!實驗室 2019-02-18 16:48:00
當今高效能運算(HPC, High Performance Computing)領域中,大多數是以工作站或伺服器主機板,搭配單顆或多顆Intel Xeon家族處理器,以及超多記憶體與硬碟容量,必要時還會增加繪圖加速卡,以建構出超高效能運算主機,來處理各種超大量的工作(Single Heavy-loading Task)或是多項小量的工作(Multi-task),讓多而複雜的工作能夠快速完成。
這類型的工作站電腦,大多是針對各行各業的專業創作與工程人員(專業美工、工程師、遊戲設計師、動畫特效師、醫療人員、科學家等等),來進行各種專業繪圖、即時工程繪圖、醫療繪圖、即時運算、工程運算、資料分析、專業級影片處理/後製/轉檔、各種特效合成…等工作。當然,也有更高階的伺服器電腦,其適用於各種研究單位與專案團隊 (諸如物理類、生物類、醫學類、天文類…等等),來進行各種研究計畫,透過深度學習、模擬演算,來獲取各種預測結果,或者讓辨識結果更精準。
直立式伺服器(Tower Server)主機,其實就跟一般消費性的直立式電腦桌機外型類似,同樣採用直立式外型設計,但其散熱與擴充能力則更強化,以便可以安裝ATX/BTX等級的伺服器主機板,並可安裝更多高階的擴充卡,安裝更多的儲存裝置,讓該電腦工作站/伺服器能夠拿來進行專業繪圖或科學研究等領域的高階運算應用。
技嘉W291-Z00直立式伺服器,採用AMD EPYC處理器平台,可發揮其強大運算能力及豐富I/O頻寬等優勢,搭配可以安裝最多4張運算加速卡(支援CUDA、OpenCL之GPGPU),可應用在各種高效能運算等工作,像是各種科學模擬、機器學習、人工智慧,或是大數據資料庫分析處理等超大負載需求的工作,相較於Intel Xeon平台來說,AMD EPYC伺服器擁有更好的經濟成本效益與強大運算能力,可說是個人工作室、中小企業、大學等組織在設置HPC工作站/伺服器時的絕佳選擇。
接下來看看這台技嘉伺服器所搭配的處理器、記憶體與繪圖加速卡等元件吧!
在技嘉這塊主機板中,搭載的BMC晶片為ASPEED的AST2500遠端管理控制晶片。該晶片本身就是一顆800MHz ARM11處理器,可搭配DDR3/DDR4記憶體來當作管控整個電腦系統的附屬小電腦,再搭配一顆SK Hynix H5AN4G6NAFR-UHC DDR4-1600 512KB記憶體來做為系統運作之用。至於管控介面,則採用AMI的MegaRAC SP-X BMC韌體,以做為遠端管理控制之用。網路傳輸則是透過RMCP (Remote Management Control Protocol) 的封包格式,讓BMC可以經由LAN介面,賦予電腦管理者能夠收發IPMI(Intelligent Platform Management Interface, 智慧型平台管理介面)的訊息,達到遠端管控的目的!
以下來看看這個BMC管理介面可以做到的事情!
有關於NAMD,是與分子動力學有關,用來模擬大型生物分子系統的程式,即生物分子建模程式,主要是用來進行各種模擬實驗,適合科學研究單位與學術單位使用。這次我們選擇了幾種樣板,搭配不同的CPU與GPU設定組合(採用單Thread、多Thread、加入處理器親和性設定、CPU搭配單GPU、CPU搭配多GPU等組合),來測試出此伺服器的處理時間。以下就是各種測試說明與運算結果。
上述的圖表可以看出,使用一般CPU單核心運算,效能非常慢,當開啟EPYC的64執行緒全速執行時,處理時間可以馬上從分鐘級降到秒鐘級!若開啟Affinity模式,可以再降個幾秒鐘。至於搭配GPGPU來運算的話,兩張Tesla V100在這裡算是小兒科的應用,處理時間可以降低到個位數秒鐘!當此平台發揮全速之下,可以5秒鐘就搞定了!
上述的圖表可以看出,使用一般CPU單核心運算,必須算到近20分鐘的時間,實在有點慢,當開啟EPYC的64執行緒全速執行時,處理時間可以馬上從降到1分鐘內!若開啟Affinity模式可再省個4秒鐘左右。至於搭配GPGPU來運算的話,兩張Tesla V100在這裡可以提升不少處理時間,讓整體處理時間降到大約半分鐘以下!當此平台發揮全速之下,可以13秒內就完全搞定!
上述的圖表可以看出,使用一般CPU單核心運算實在太慢,超過1小時以上,要是再複雜的運算,可能算到天黑都算不完,當開啟EPYC的64執行緒全速執行之後,處理時間可以馬上從降到3分鐘內!由此可見EPYC處理器的威力!若開啟Affinity模式可再省個25秒鐘左右。當然只靠CPU來運算是不夠的,在搭配GPGPU來運算後,透過兩張Tesla V100的幫忙,可以再減少不少時間,壓低到近2分鐘左右搞定!當此平台發揮全速之下,只要半分鐘左右就完全算完了!您說,這種級距是否差很多呢?!
上述的圖表主要是以該平台全速發揮之下,透過壓縮1M、20M、210M的STMV結構,來測試整個平台的運算能耐。以前面的1M STMV為基準點來看,壓縮1M STMV大約只花16.69秒;而當STMV病毒擴大20倍之後,壓縮所需運算時間固然會增加,但測試後的處理時間只增加6.48倍。至於增加到210倍的數量時,壓縮所需的時間則是增加89.5倍。由此可看出,處理的資料量越大,此伺服器的處理速度會相對加快,以減少整個實驗計畫所需要的時間!
因此,透過上述的技嘉W291-Z00伺服器主機的介紹與評測,可以了解專業工作站/伺服器也是可以根據工作需求來自行建構的,並應用在各種專業領域,不僅能在工作上帶來更精確、更高效率的運算能力,減少運算時間以提早完成任務,讓您的工作表現更加出色!非常值得想要組裝HPC環境、但要求更經濟的預算與更彈性的擴充空間,以組裝出真正頂級工作站/伺服器的專業人士來選購。
廠商電話:0800-079-800
廠商網址:www.gigabyte.com/tw/Enterprise
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這類型的工作站電腦,大多是針對各行各業的專業創作與工程人員(專業美工、工程師、遊戲設計師、動畫特效師、醫療人員、科學家等等),來進行各種專業繪圖、即時工程繪圖、醫療繪圖、即時運算、工程運算、資料分析、專業級影片處理/後製/轉檔、各種特效合成…等工作。當然,也有更高階的伺服器電腦,其適用於各種研究單位與專案團隊 (諸如物理類、生物類、醫學類、天文類…等等),來進行各種研究計畫,透過深度學習、模擬演算,來獲取各種預測結果,或者讓辨識結果更精準。
本篇Server DIY應用,採用技嘉W291-Z00直立式伺服器主機來介紹與評測。同時也將深入介紹其採用的MZ01-CE1主機板,支援AMD EPYC處理器,該主機板具備5組PCIe插槽,可插到最多4張雙槽級的高階顯示卡/加速卡
直立式伺服器電腦,HPC應用的新選擇
由於放在機房裡面的機架式伺服器(Rack Server)電腦主機,往往受限於體積與散熱設計機制,使得1U與2U的Rack Server機種,在擴充能力上可能受到不少限制,至於4U以上等級的機種雖然空間比較高,但其擴充能力未必有桌上的直立式主機那樣方便,對於需要有彈性應用與擴充功能的使用環境,而不需要動用到機架等級的使用者來說,選擇直立式的伺服器主機,將會是更實際且經濟的選擇。直立式伺服器(Tower Server)主機,其實就跟一般消費性的直立式電腦桌機外型類似,同樣採用直立式外型設計,但其散熱與擴充能力則更強化,以便可以安裝ATX/BTX等級的伺服器主機板,並可安裝更多高階的擴充卡,安裝更多的儲存裝置,讓該電腦工作站/伺服器能夠拿來進行專業繪圖或科學研究等領域的高階運算應用。
技嘉W291-Z00 Tower Server,打造最強AMD平台伺服器
以技嘉新推出的W291-Z00直立式伺服器主機,便是一款旗艦級的Tower Server。機身採用全鋁設計,剛韌十足,搭配其超大的內部空間,以及風速夠強勁的散熱風扇(含機身後12公分系統散熱風扇,以及機身前2組12公分擴充卡散熱風扇),可為系統內部發熱元件快速降溫。此外,前置面板則另提供4組3.5吋/2.5吋磁碟機槽,可支援熱插拔,上面預留一組3.5吋磁碟機槽可安裝其他儲存裝置,整個伺服器主機必備的功能可說是非常齊備!技嘉W291-Z00直立式伺服器,採用AMD EPYC處理器平台,可發揮其強大運算能力及豐富I/O頻寬等優勢,搭配可以安裝最多4張運算加速卡(支援CUDA、OpenCL之GPGPU),可應用在各種高效能運算等工作,像是各種科學模擬、機器學習、人工智慧,或是大數據資料庫分析處理等超大負載需求的工作,相較於Intel Xeon平台來說,AMD EPYC伺服器擁有更好的經濟成本效益與強大運算能力,可說是個人工作室、中小企業、大學等組織在設置HPC工作站/伺服器時的絕佳選擇。
技嘉W291-Z00系統方塊圖,可支援AMD EPYC家族處理器,提供4組PCIe 3.0 x16、1組PCIe 3.0 x8,可支援8條DDR4記憶體,另提供4組SlimLine SAS插槽可提供共16組SATA 6Gbps裝置,而本系統主機的空間最多可以安裝共12組SATA裝置,應已能滿足絕大多數使用者需求。另提供4組USB 3.0埠(前置2組、後置2組)。另搭配Aspeed遠端管理控制晶片,提供2組1Gb/s LAN埠,可另有一組管理埠,可透過遠端來監控該伺服器的狀況。
支援AMD EPYC處理器平台,伺服器主機板絕佳新選擇
這款直立式伺服器,內部配備了技嘉MZ01-CE1伺服器主機板,支援AMD EPYC 7000系列的伺服器處理器,具有8組記憶體插槽,可支援8通道RDIMM/LRDIMM DDR4記憶體,最高可擴充到1TB。在儲存方面,支援4組SlimLine SAS埠 (共可支援16組SATA 6Gb/s儲存裝置),搭配主機的空間可安裝到最多12組SATA儲存裝置。主機板也提供1組Ultra-Fast M.2 22110插槽(支援PCIe Gen.3 x4的NVMe SSD)。在PCIe插槽方面則提供4組PCIe Gen.3 x16與1組PCIe Gen.3 x8的插槽,因此要安裝4張佔用雙Slot的繪圖卡/加速卡來說,絕對沒問題!這張就是該伺服器所配置的技嘉MZ01-CE1主機板,採用Socket SP3插槽,可支援AMD EPYC家族處理器,提供4組PCIe 3.0 x16與1組PCIe 3.0 x8,以及8條DDR4記憶體插槽,左下方有4組SlimLine SAS插槽可提供共16組SATA 6Gbps裝置
支援Socket SP3 (LGA-4094)插槽,可支援AMD EPYC處理器 (註:另外衍生出來的Socket SP3r2插槽,或稱Socket TR4,則是專門設計給AMD Ryzen Threadripper處理器使用的,兩種插槽互不相容!),CPU插槽兩側共有8條DIMM到插槽,支援DDR4-2666 RDIMM或LRDIMM,最高可擴充到1TB
主機板上配置了ASPEED (信驊科技)的AST2500伺服器管理晶片,賦予伺服器平台能夠免on-site的控制能力,只要有連接網路,再遠的地方都可以透過遠端連線的方式來開關機、監控從BIOS、OS到App的畫面,更可透過虛擬ISO檔案來安裝OS,非常方便
技嘉W291-Z00 Tower Server內部檢視
接下來再仔細看看技嘉W291-Z00直立式伺服器主機的各項特色。整機採用鋁金屬材質,搭配絕佳的散熱導流設計,可快速將熱量帶出機殼外。主機前置面板具有鎖定功能,可防止其他人隨意動用該主機、或拆開主機殼。前置面板左下方可以看到各種燈號,右邊配置許多散熱孔有利於散熱。翻開前置門之後,即可看到熱插拔硬碟槽,上方預留磁碟槽,下方預留散熱風扇安裝槽。左下方則有USB 3.0與按鈕等前置燈號面板,讓管理者能夠輕鬆進行擴充、更換、維護等動作。此LITEON電源供應器可說是不簡單,小小體積便具有1000W的最大輸出功率 (若是220V輸入,則最大輸出功率達1600W),且是80 PLUS Platinum認證,可提供充電電量給CPU、GPGPU、Storage等元件裝置。若發生故障,或是通電不正常,就會發出持續性的尖銳警告聲,以告訴管理者趕快來排解問題
接下來看看這台技嘉伺服器所搭配的處理器、記憶體與繪圖加速卡等元件吧!
Server處理器:AMD EPYC 7601
這就是AMD EPYC 7601處理器,採用LGA 4094腳位。具有32C64T,基礎時脈為2.2GHz、最大超頻時脈為3.2GHz,所有核心加速可到2.7GHz,總計L3快取達64MB,PCIe通道數達128條,TDP為180W
DDR4 RDIMM記憶體:V-Color TR416G2D819-VHM
GPU加速卡:NVIDIA Tesla V100
專屬BMC埠,提供遠端開關機與螢幕監控功能
至於網路埠方面,技嘉MZ01-CE1主機板除內建2組1Gb/s的LAN埠之外,還配置了1組遠端管理專用的BMC (Baseboard Management Controller)埠,讓此伺服器得以透過LAN的方式來進行遠端監控、設定與管理。在技嘉這塊主機板中,搭載的BMC晶片為ASPEED的AST2500遠端管理控制晶片。該晶片本身就是一顆800MHz ARM11處理器,可搭配DDR3/DDR4記憶體來當作管控整個電腦系統的附屬小電腦,再搭配一顆SK Hynix H5AN4G6NAFR-UHC DDR4-1600 512KB記憶體來做為系統運作之用。至於管控介面,則採用AMI的MegaRAC SP-X BMC韌體,以做為遠端管理控制之用。網路傳輸則是透過RMCP (Remote Management Control Protocol) 的封包格式,讓BMC可以經由LAN介面,賦予電腦管理者能夠收發IPMI(Intelligent Platform Management Interface, 智慧型平台管理介面)的訊息,達到遠端管控的目的!
以下來看看這個BMC管理介面可以做到的事情!
若需要透過遠端來安裝作業系統,只要在右上方的「CD映像檔」欄位上,選定好要安裝的作業系統ISO檔,然後在BIOS的Boot選單裡面,就會有個Virtual CDROM的項目,將該項目調到Boot Option #1即可。這樣一來,安裝作業系統就不需要準備USB隨身碟或實體光碟了
Windows 10平台下之資訊檢視
一般而言,HPC電腦大多會以Linux相關OS來當主要作業系統,比較少會用來安裝Windows平台。不過為了檢視此伺服器也能執行Windows 10,我們也嘗試安裝完成,並透過Windows 10平台來檢測此伺服器電腦。專業繪圖領域方面效能簡單測試
以下我們透過Luxmark與Blender的Linux版本,來檢測這樣平台的整體效能。雖說一般做圖檔的Render,是不需要動用到這樣高檔的加速卡,只需要用到Quadro、FireGL等級的專業繪圖卡即可。但為測試出此平台一樣也能進行專業繪圖應用,因此也拿進行測試,而測試結果也僅供參考。Blender測試
LuxMark測試
科學研究方面效能測試
接下來我們就要正式透過HPC等級的大量運算測試程式,來檢測此伺服器的能耐。這次我們使用的是NAMD2測試軟體,來測試技嘉W291-Z00伺服器在處理大量分子運動模擬時,所需要的運算時間。有關於NAMD,是與分子動力學有關,用來模擬大型生物分子系統的程式,即生物分子建模程式,主要是用來進行各種模擬實驗,適合科學研究單位與學術單位使用。這次我們選擇了幾種樣板,搭配不同的CPU與GPU設定組合(採用單Thread、多Thread、加入處理器親和性設定、CPU搭配單GPU、CPU搭配多GPU等組合),來測試出此伺服器的處理時間。以下就是各種測試說明與運算結果。
ApoA1測試
ApoA1是「載脂蛋白A1」 (Apolipoprotein A1)的簡稱,是血液中高密度脂蛋白(HDL)的主要蛋白質成分,在脂類代謝中起特殊作用。ApoA1的基準測試,是由92,224個原子組成,多年來一直是標準NAMD跨平台測試的基準測試,因此我們也使用ApoA1來進行測試。以下就是這次測試的比較結果。上述的圖表可以看出,使用一般CPU單核心運算,效能非常慢,當開啟EPYC的64執行緒全速執行時,處理時間可以馬上從分鐘級降到秒鐘級!若開啟Affinity模式,可以再降個幾秒鐘。至於搭配GPGPU來運算的話,兩張Tesla V100在這裡算是小兒科的應用,處理時間可以降低到個位數秒鐘!當此平台發揮全速之下,可以5秒鐘就搞定了!
F1-ATPase測試
ATP合成酶是酶的一種,主要用於合成細胞中常見的分子能量單元,即三磷酸腺苷 (ATP)。生物馬達分子主要為ATPase,為一跨細胞膜之旋轉 (protein domain, F1),因此F1-ATPase的基準測試,就是ATP合成酶的F1子單元的模型,F1-ATPAse使用到327,506個原子。此測試對於系統的需求會更為繁重一些,因此我們也列入測試項目。上述的圖表可以看出,使用一般CPU單核心運算,必須算到近20分鐘的時間,實在有點慢,當開啟EPYC的64執行緒全速執行時,處理時間可以馬上從降到1分鐘內!若開啟Affinity模式可再省個4秒鐘左右。至於搭配GPGPU來運算的話,兩張Tesla V100在這裡可以提升不少處理時間,讓整體處理時間降到大約半分鐘以下!當此平台發揮全速之下,可以13秒內就完全搞定!
STMV (病毒) 測試
衛星煙草花葉病毒 (STMV, Satellite Tobacco Mosaic Virus) 是一種小型二十面體植物病毒,它會使煙草花葉病毒 (TMV) 的感染症狀惡化。而SMTV 則是可以研究分子動力學的絕佳測試項目之一,因為在各類病毒中,它相對較小,且在工作站或小型伺服器上,可以使用傳統的分子動力學模擬的對象中,是屬於中高等級的。STMV動用到1,066,628個分子。對於多處理器系統的效能表現會更加明顯,所以我們也列入測試項目。上述的圖表可以看出,使用一般CPU單核心運算實在太慢,超過1小時以上,要是再複雜的運算,可能算到天黑都算不完,當開啟EPYC的64執行緒全速執行之後,處理時間可以馬上從降到3分鐘內!由此可見EPYC處理器的威力!若開啟Affinity模式可再省個25秒鐘左右。當然只靠CPU來運算是不夠的,在搭配GPGPU來運算後,透過兩張Tesla V100的幫忙,可以再減少不少時間,壓低到近2分鐘左右搞定!當此平台發揮全速之下,只要半分鐘左右就完全算完了!您說,這種級距是否差很多呢?!
STMV (病毒) 分子數壓縮測試
在額外測試方面,由於STMV的基準測試使用到大約1M個分子,而另有一個測試,可以額外產生出20倍與210倍的STMV分子,並測試壓縮STMV結構所需要的時間。這樣的壓縮測試將會把系統整個128GB記憶體用好用滿。我們也進行這樣的超大系統負載測試。上述的圖表主要是以該平台全速發揮之下,透過壓縮1M、20M、210M的STMV結構,來測試整個平台的運算能耐。以前面的1M STMV為基準點來看,壓縮1M STMV大約只花16.69秒;而當STMV病毒擴大20倍之後,壓縮所需運算時間固然會增加,但測試後的處理時間只增加6.48倍。至於增加到210倍的數量時,壓縮所需的時間則是增加89.5倍。由此可看出,處理的資料量越大,此伺服器的處理速度會相對加快,以減少整個實驗計畫所需要的時間!
結語
整體而言,技嘉這款AMD EPYC平台的直立式伺服器主機,不僅擁有強大的CPU運算能力與I/O傳輸頻寬,搭配支援更多的記憶體容量,並可擴充4張專業繪圖卡或繪圖加速卡,賦予專業人士進行各種專業繪圖或科學研究、深度學習、AI等應用,最重要的是建置這樣一台AI等級的超級工作站時,能夠擁有更多的擴充彈性,包含CPU等級、記憶體容量多寡、各種不同的磁碟機配置方式,以及擴充卡的添購與否,這些都是可以自己做彈性的選擇,未來若有需要也可以進行擴充,不需要整台換掉!因此,透過上述的技嘉W291-Z00伺服器主機的介紹與評測,可以了解專業工作站/伺服器也是可以根據工作需求來自行建構的,並應用在各種專業領域,不僅能在工作上帶來更精確、更高效率的運算能力,減少運算時間以提早完成任務,讓您的工作表現更加出色!非常值得想要組裝HPC環境、但要求更經濟的預算與更彈性的擴充空間,以組裝出真正頂級工作站/伺服器的專業人士來選購。
廠商資訊
廠商名稱:GIGABYTE Server 技嘉伺服器 - GIGA COMPUTING 技鋼科技股份有限公司廠商電話:0800-079-800
廠商網址:www.gigabyte.com/tw/Enterprise
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